CiNiiからRef2000へのBibTexデータの読み込み

文献の整理にRef2000を使っているのだが、普通にCiNiiからBibTex形式でダウンロードして、データをRef2000にインポートさせてもタグ付テキストファイルではないといわれたり、データが多いと落ちてしまったりする。
ダウンロードしたデータをメモ帳で開くと、改行記号がそのまま　↑　で表示され、実際の改行として認識されていない。
文字コードの問題と思われる。　ダウンロードデータはUnicodeでRef2000はShift-JIS。
今度はワードパッドで表示させてみた。すると改行がちゃんと改行として認識されている。
ワードパッドで一度読み込んでからテキストで保存し（拡張子はtxtになってしまう）、これをメモ帳で読み込むと、改行が直っている。
そこでこのファイルの拡張子をbibに変えてやりRef2000にインポートするとうまくいった。
ただし定義されていないフィールドがあると言われてしまうので、何かそういう項目があるのでしょう。
ちなみにこれはOSをXpとした場合。